Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r2Q0VGB7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp4r2Q0VGB7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp4r2Q0VGB7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms