Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b3Q0VF55 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b3Q0VF55 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms