Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rundc1Q0VDN7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rundc1Q0VDN7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms