Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem52bQ0VBF2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms