Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r181Q0P547 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r181Q0P547 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms