Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms