Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc21bQ0HA38 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ttc21bQ0HA38 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms