Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxc4Q08624 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc4Q08624 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms