Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff1Q08423 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff1Q08423 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms