Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CluQ06890 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CluQ06890 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CluQ06890 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CluQ06890 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CluQ06890 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CluQ06890 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CluQ06890 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CluQ06890 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CluQ06890 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CluQ06890 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CluQ06890 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CluQ06890 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CluQ06890 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms