Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fmn1Q05860 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fmn1Q05860 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms