Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcr5Q04683 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms