Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelaQ04207 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelaQ04207 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RelaQ04207 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms