Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Thbs2Q03350 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs2Q03350 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms