Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddr1Q03146 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms