Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NfiaQ02780 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms