Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Muc1Q02496 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Muc1Q02496 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms