Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnnb1Q02248 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnnb1Q02248 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms