Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl1Q02067 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl1Q02067 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms