Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd1Q01822 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms