Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec23aQ01405 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms