Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Top2aQ01320 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2aQ01320 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms