Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EgfrQ01279 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms