Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SelpQ01102 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SelpQ01102 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SelpQ01102 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms