Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin2cQ01098 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2cQ01098 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms