Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde1bQ01065 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde1bQ01065 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms