Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Serpina1cQ00896 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1cQ00896 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms