Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col8a1Q00780 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col8a1Q00780 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms