Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Il6stQ00560 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il6stQ00560 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms