Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pou1f1Q00286 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou1f1Q00286 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms