Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb4P99026 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb4P99026 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb4P99026 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 966.6 ms