Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama4P97927 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama4P97927 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lama4P97927 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama4P97927 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms