Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cry1P97784 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cry1P97784 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms