Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smarcc1P97496 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc1P97496 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms