Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nbr1P97432 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms