Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LystP97412 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LystP97412 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LystP97412 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LystP97412 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LystP97412 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LystP97412 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LystP97412 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LystP97412 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LystP97412 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LystP97412 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LystP97412 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LystP97412 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LystP97412 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LystP97412 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms