Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig3P97386 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig3P97386 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.5 ms