Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps3aP97351 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms