Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pkp1P97350 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp1P97350 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp1P97350 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms