Protein–RNA interactions for Protein: P97304

Polr1d, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1dP97304 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1dP97304 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1dP97304 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1dP97304 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms