Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbx1P82976 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms