Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Otx2P80206 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx2P80206 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms