Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx1P80205 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx1P80205 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms