Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfi1P70338 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms