Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf6P70196 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf6P70196 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf6P70196 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms