Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf5P70191 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Traf5P70191 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf5P70191 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf5P70191 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf5P70191 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf5P70191 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Traf5P70191 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf5P70191 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf5P70191 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf5P70191 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf5P70191 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf5P70191 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf5P70191 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf5P70191 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf5P70191 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf5P70191 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf5P70191 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf5P70191 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf5P70191 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf5P70191 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms