Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SbdsP70122 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbdsP70122 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms