Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbdP63072 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbdP63072 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbdP63072 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbdP63072 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbdP63072 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms