Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps11P62281 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms