Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms